Taisei Oonari marzy o pilotowaniu Shinkaliona, lecz musi najpierw udowodnić, że potrafi współpracować z innymi. Nowa generacja transformujących się pociągów broni świata przed tajemniczym zagrożeniem związanym z rozwojem sieci kolejowej. Seria łączy robotyczne bitwy, technologię i dojrzewanie młodych maszynistów.