Trzydziesci piec lat po tym, jak Lynn Minmay przyniosla pokoj miedzy ludzmi a Zentradi, po galaktyce podrozuje kolonia City 7 w poszukiwaniu planety do zamieszkania. Zyje w niej Nekki Basara, gitarzysta i wokalista zespolu Fire Bomber.

Basara wierzy, ze muzyka kryje w sobie ogromna moc, dlatego gdy kolonie atakuje tajemnicza obca rasa, on odpowiada nie bronia, lecz spiewem. Macross 7 to nietuzinkowa odslona sagi Macross, laczaca akcje mecha z motywem muzyki jako sily zdolnej zmieniac swiat.