Ponyo jest niezwykłą złotą rybką, która ucieka z podwodnego domu i trafia pod opiekę pięcioletniego Sōsuke. Ich szybko rodząca się przyjaźń sprawia, że Ponyo pragnie zostać człowiekiem. Użycie potężnej magii zaburza jednak równowagę morza i wywołuje serię niezwykłych zdarzeń. Film opowiada prostą, pełną ciepła historię o dziecięcej lojalności, rodzinie oraz harmonii między ludźmi i naturą.