Po katastrofie cywilizacja upadła, a opuszczone miasta zamieszkują niebezpieczne potwory. Maru i Kiruko przemierzają ruiny Japonii w poszukiwaniu tajemniczego miejsca określanego jako Niebo. Równolegle grupa dzieci żyje w odizolowanej placówce, nie znając świata za jej murami. Obie historie stopniowo odsłaniają swoje powiązania. Tengoku Daimakyo to tajemnicza opowieść postapokaliptyczna o przetrwaniu, tożsamości i ukrytych eksperymentach.