Tajemniczy błysk zamienia wszystkich ludzi na Ziemi w kamień. Po kilku tysiącach lat genialny licealista Senku Ishigami uwalnia się z kamiennej powłoki i odkrywa świat odzyskany przez naturę. Zamiast polegać na sile, rozpoczyna odbudowę technologii od podstaw, wykorzystując chemię, fizykę i inżynierię. Dr. STONE łączy przygodę, humor i popularnonaukowe eksperymenty z konfliktem o to, jak powinna wyglądać nowa cywilizacja.