009 Re:Cyborg to wspolczesna reinterpretacja klasyki Shotaro Ishinomori o dziewiatce cyborgow stworzonych przez tajemnicza organizacje i obdarzonych nadludzkimi zdolnosciami. Po latach spokoju bohaterowie zostaja ponownie zjednoczeni, gdy swiat nawiedza fala niewyjasnionych zamachow inspirowanych zagadkowym glosem.

Joe Shimamura, czyli cyborg 009, wraz z towarzyszami probuje rozwiklac zagadke stojaca za atakami i zmierzyc sie z pytaniami o wiare, wolna wole i przeznaczenie ludzkosci. Realizowany w technice laczacej animacje z grafika komputerowa film nadaje kultowej serii mroczny, filozoficzny ton.