Drugi sezon rozwija podróż Coco, dziewczyny, która odkryła, że magia powstaje dzięki odpowiednio rysowanym znakom. Pod opieką Qifreya i u boku pozostałych uczennic rozwija swoje umiejętności, mierzy się z bardziej wymagającymi zadaniami oraz konsekwencjami zakazanej wiedzy. Zachwyt nad tworzeniem czarów przeplata się z pytaniami o zasady narzucone przez społeczność magów. Coco coraz lepiej rozumie, że każdy symbol może nieść zarówno pomoc, jak i zagrożenie.