Rokuro Okajima jest japońskim pracownikiem korporacji, który podczas podróży służbowej zostaje porwany przez najemników z Lagoon Company. Porzucony przez własną firmę przyjmuje nowe imię Rock i dołącza do załogi działającej w bezprawnym Roanapur. Wraz z Revy, Dutchem i Bennym realizuje zlecenia dla mafii, przemytników oraz innych grup przestępczych. Black Lagoon to dynamiczna seria sensacyjna o moralnych kompromisach i przetrwaniu.