Lucy należy do nowego gatunku ludzi obdarzonych niewidzialnymi ramionami o ogromnej sile. Po krwawej ucieczce z tajnego ośrodka doznaje urazu i przyjmuje łagodną, dziecięcą osobowość nazwaną Nyu. Odnajdują ją Kōta i Yuka, nieświadomi jej pochodzenia ani polujących na nią służb. Historia łączy dramat bohaterów z brutalną opowieścią o odrzuceniu, eksperymentach i konsekwencjach przemocy, stopniowo odsłaniając wspólną przeszłość Lucy i Kōty.