Dodatkowe lekcje klasy 3-E pokazują zadania i szkolne przygody, które nie znalazły się w głównym nurcie drugiego sezonu. Uczniowie nadal doskonalą umiejętności potrzebne do pokonania Koro-senseia, jednocześnie korzystając z jego nietypowych metod nauczania. Krótkie historie łączą akcję, humor i rozwój grupy, przypominając, że ich najważniejsza misja jest także lekcją dorastania.