Senku i Królestwo Nauki rozpoczynają decydujący etap planu przywrócenia całej ludzkości. Po zdobyciu nowych środków i wiedzy drużyna kieruje uwagę poza Japonię, gdzie czekają źródła technologii, nowi przeciwnicy oraz odpowiedzi dotyczące tajemnicy petryfikacji.

Dr. STONE SCIENCE FUTURE kontynuuje wydarzenia New World i prowadzi serię ku finałowym wyprawom. Nauka, strategia i współpraca nadal są główną bronią Senku.