Tokio, rok 1969. Ziemia znajduje się pod atakiem tajemniczych Najeźdźców, o czym opinia publiczna nie ma jednak pojęcia. Zagrożenie jest bardzo realne dla tajnej organizacji A.E.G.I.S., której zadaniem jest powstrzymanie inwazji.

Kluczem do obrony są Strażnicy Bram — młodzi ludzie obdarzeni mocą otwierania wrót do innego wymiaru. Gate Keepers studia GONZO to pełna akcji, retro opowieść science fiction o nastolatkach broniących świata, w której walka z obcymi splata się z klimatem Japonii lat sześćdziesiątych.