Choć brzmi to niewiarygodnie, energiczna gimnazjalistka Jiyu Nanohana zwana Jubei jest reinkarnacją legendarnego samuraja Yagyu Jubei. Gdy zakłada baśniową Uroczą Przepaskę na oko, przemienia się w niszczycielską mistrzynię miecza i przejmuje moc dawnego wojownika.

Wkrótce na jej drodze staje klan Ryujoji, wciąż pragnący pomścić dawną porażkę. Juubei-chan: Lovely Gantai no Himitsu to szalona, pełna humoru i efektownych pojedynków opowieść o zwyczajnej dziewczynie wplątanej w wielowiekową samurajską wendetę, w której komedia miesza się z dynamiczną akcją.