Yui, Mio, Ritsu, Tsumugi i Azusa wracają do szkolnego klubu muzyki lekkiej. Ostatni rok starszych członkiń zespołu wypełniają próby, występy, wycieczki oraz codzienne chwile, które stopniowo uświadamiają im, że wspólny czas zbliża się do końca.

Drugi sezon K-ON! rozwija przyjaźń dziewczyn i ich życie szkolne. Muzyka pozostaje ważna, ale centrum opowieści stanowią relacje, humor i emocje związane z nadchodzącym ukończeniem szkoły.