Film przypomina najważniejsze wydarzenia z pierwszego sezonu Kaiju No. 8. Kafka Hibino, pracownik ekipy sprzątającej szczątki potworów, niespodziewanie zyskuje moc kaiju i próbuje spełnić dawną obietnicę dołączenia do Sił Obrony, ukrywając jednocześnie swoją przemianę.

Kaiju No. 8: Mission Recon jest kinowym podsumowaniem serialu z dodatkowym materiałem. Może służyć jako odświeżenie historii przed drugim sezonem, ale nie zastępuje pełnego rozwoju bohaterów z oryginalnej serii.