Kouta Oyamada, nieśmiały chłopak ze wsi, rozpoczyna naukę w miejskiej szkole, gdzie natychmiast wpada w oko Chizuru, energicznej dziewczynie skrywającej naturę lisiego ducha. Wkrótce o jego względy zaczyna rywalizować także chłodna Nozomu, wilczyca w ludzkiej skórze, przez co spokojne życie bohatera zamienia się w istny chaos.

Kanokon to lekka komedia romantyczna z wyraźną dawką fanserwisu, oparta na motywach japońskiego folkloru o duchach zwierząt. Serial stawia w całości na żartobliwy ton, przerysowane sytuacje i nieustanne, natarczywe zaloty bohaterek, tworząc niezobowiązującą rozrywkę dla miłośników gatunku.