Keita to licealista przygotowujący się do ważnych egzaminów, którego spokój nieustannie burzą dwie starsze przyrodnie siostry bliźniaczki, Ako i Riko. Obie otwarcie rywalizują o jego względy, otaczając chłopaka natarczywą, kłopotliwą troską, wobec której trudno mu zachować chłodną głowę.

kiss×sis to komedia romantyczna z wyraźną dawką fanserwisu, oparta na krępujących sytuacjach i przekomarzankach w nietypowym rodzinnym trójkącie. Serial utrzymany jest w żartobliwym, przerysowanym tonie, stawiając na lekki humor i coraz śmielszą rywalizację obu sióstr o uwagę zakłopotanego bohatera.