W niedalekiej przyszłości ludzie i roboty żyją obok siebie, a wśród dzieci ogromną popularnością cieszą się Robattle — pojedynki, w których walczą ze sobą roboty zwane Medabotami. Świadomość, a właściwie mózg Medabota, mieści się w specjalnym Medalu.

Młody Ikki marzy o własnym Medabocie i wkrótce zdobywa niezwykłego partnera — Metabee. Medarot to pełna akcji i humoru opowieść przygodowa dla młodszych widzów, w której robotowe pojedynki splatają się z przyjaźnią, rywalizacją i dorastaniem młodego zawodnika marzącego o zostaniu mistrzem.