W przyszłości, w której ludzkość podzielona jest między trzy rywalizujące bloki energetyczne, na scenę wkracza tajemnicza organizacja Celestial Being, dysponująca potężnymi Gundamami. Jej piloci, na czele z enigmatycznym Setsuną, postanawiają zbrojnie interweniować we wszystkich konfliktach świata, dążąc do wymuszenia globalnego pokoju.

Mobile Suit Gundam 00 to widowiskowa produkcja mecha, w której efektowne bitwy potężnych robotów splatają się z rozbudowaną intrygą polityczną i poważnymi pytaniami o naturę wojny i pokoju. Dramaty pilotów oraz moralna dwuznaczność ich misji nadają starciom Gundamów głębi wykraczającej poza zwykłe widowisko.