Banagher Links spotyka tajemniczą Audrey Burne i zostaje uwikłany w walkę o Puszkę Laplace’a, sekret mogący zachwiać porządkiem Federacji. Jako pilot Unicorn Gundama musi wybierać między rozkazami walczących stron a własnym przekonaniem, że przyszłość ludzi w kosmosie nie powinna zależeć od przemocy.

Telewizyjna wersja porządkuje wydarzenia znane z OVA w odcinkową opowieść. Konflikt wokół rodu Vist, Neo Zeon i prawdziwego znaczenia Karty Stulecia Uniwersalnego łączy widowiskowe bitwy z pytaniami o pamięć historyczną, uprzedzenia wobec Newtype’ów i dziedzictwo dawnych wojen.