Hikari Hanazono od dziecka trenuje ze wszystkich sił, by choć raz pokonać Keia Takishimę, chłopaka, który niezmiennie plasuje się tuż przed nią na pierwszym miejscu. Oboje należą do elitarnej grupy najlepszych uczniów prestiżowej szkoły, a ich zacięta rywalizacja stopniowo przeradza się w coś znacznie cieplejszego.

S.A: Special A to pogodna komedia romantyczna, w której nieustanna rywalizacja dwójki bohaterów staje się pretekstem do opowieści o dojrzewaniu uczuć i przełamywaniu własnej dumy. Barwna galeria ekscentrycznych kolegów, lekki humor i ciepły wątek miłosny składają się na sympatyczną, rozrywkową całość.