Gdy doktor Eggman zbiera wszystkie siedem Szmaragdów Chaosu (Chaos Emeralds) i jest już bliski zdobycia absolutnej mocy, w jego plany wtrąca się Sonic — a powstała eksplozja przenosi wszystkich z ich rodzimej planety na Ziemię.

Tam Sonic i jego przyjaciele łączą siły z dwunastoletnim Christopherem Thorndyke, by odzyskać rozproszone Szmaragdy Chaosu i pokrzyżować plany złowrogiego Eggmana. Sonic X to dynamiczna, pełna akcji i humoru przygodowa opowieść oparta na kultowej serii gier o błękitnym jeżu pędzącym z prędkością dźwięku.