W Mieście Śmierci działa akademia prowadzona przez samego Shinigamiego. Młodzi mistrzowie walczą u boku partnerów potrafiących zmieniać się w broń, zbierając dusze niebezpiecznych istot. Maka i Soul, Black Star i Tsubaki oraz Death the Kid z siostrami Thompson stopniowo odkrywają spisek zagrażający całemu światu. Ich przeciwnicy wykorzystują strach i szaleństwo, dlatego bohaterowie muszą rozwijać nie tylko siłę, lecz także zaufanie i zdolność współpracy.