The Birth of Kitaro: The Mystery of GeGeGe to mroczna opowiesc o pochodzeniu bohatera slynnej serii o yokai. Akcja przenosi widza do powojennej Japonii, gdzie tajemniczy przybysz o imieniu Mizuki trafia do odleglej wioski skrywajacej makabryczne sekrety i powiazania ze swiatem duchow.

W centrum historii znajduje sie spotkanie Mizukiego z ostatnim przedstawicielem plemienia Ducha oraz kobieta, ktorej losy zwiaza sie z narodzinami Kitaro. Utrzymany w klimacie grozy i tajemnicy obraz odslania ponure zrodla legendy, laczac horror z refleksja nad chciwoscia i ludzka natura.