Akari i Hiroyuki znają się i przyjaźnią, odkąd tylko sięgają pamięcią. Z czasem jednak wszystko się zmienia, a uczucia Akari wobec przyjaciela z dzieciństwa przeradzają się w coś znacznie głębszego. Wraz z początkiem nowego semestru w liceum dziewczyna staje przed pytaniem, czy zdoła je wyznać.

Wokół pary toczy się barwne, codzienne życie szkolne, pełne kolegów, drobnych trosk i pierwszych zauroczeń. To Heart to spokojny, nastrojowy dramat obyczajowy o dojrzewaniu, przyjaźni i nieśmiałej, powoli rozkwitającej miłości, w którym najważniejsze bywają ciche, ulotne chwile.