Arata i członkinie Trinity Seven trafiają w centrum incydentu związanego z tajemniczą biblioteką oraz dziewczyną nazywającą go ojcem. Nowa misja prowadzi do starcia z magicznymi siłami zagrażającymi równowadze znanego im świata.

Eternal Library & Alchemic Girl to filmowa historia osadzona po wydarzeniach serialu Trinity Seven. Zachowuje magiczną akcję, komedię i relacje między członkami akademii.