Accelerator, najpotężniejszy esper Akademii, próbuje chronić Last Order po wydarzeniach, które zmieniły jego życie. Spotkanie z tajemniczą organizacją prowadzi go do walki z grupą wykorzystującą magię i eksperymenty. Brutalny antybohater musi zdecydować, jak daleko posunie się, by ocalić tych, których uznał za bliskich.