W niedalekiej przyszlosci znaczna czesc Ziemi znika pod woda lub zostaje zniszczona przez trzesienia ziemi. W centrum kataklizmow znajduje sie tajemniczy obiekt zwany Orphanem, ktory dazy do wydobycia na powierzchnie ukrytego gleboko pod morzem statku.

Powodzenie tego planu oznaczaloby jednak zaglade niemal calej ludzkosci. Agenci Orphana pilotuja grozne mechy, poszukujac na calym swiecie tajemniczych organicznych plyt, z ktorych rodza sie roboty. Wsrod nich jest tytulowy Brain Powerd, maszyna zdolna stanac po stronie ludzi. Seria Yoshiyukiego Tomino laczy widowiskowa akcje mecha z metaforyka narodzin i odrodzenia.