Agencja Detektywistyczna zostaje uwikłana w sprawę, która podważa jej reputację i zmienia dotychczasowy układ sił w Jokohamie. Atsushi, Dazai i pozostali członkowie muszą działać pod presją, gdy nowi przeciwnicy wykorzystują zarówno nadnaturalne zdolności, jak i wpływy instytucji.

Czwarty sezon Bungo Stray Dogs rozwija przeszłość agencji oraz prowadzi bohaterów do rozległego spisku. To bezpośrednia kontynuacja wcześniejszych serii, łącząca śledztwo, akcję i charakterystyczne literackie inspiracje.