Ryūko Matoi przybywa do Akademii Honnōji, szukając właściciela drugiej połowy ogromnych nożyczek i odpowiedzi na pytanie o śmierć ojca. Szkołą rządzi Satsuki Kiryūin, a jej elitarni uczniowie korzystają z mundurów dających nadludzką moc. Ryūko odnajduje żywy strój Senketsu i rozpoczyna serię widowiskowych pojedynków. Za szkolną rywalizacją kryje się jednak większy konflikt związany z pochodzeniem niezwykłych włókien oraz rodziną obu bohaterek.