Minęły dwa lata od operacji, która poważnie zmieniła układ sił w Tokio. Haise Sasaki dowodzi oddziałem Quinx — grupą śledczych CCG wykorzystujących moce ghuli — lecz sam nie potrafi w pełni zrozumieć luk we własnej pamięci.

„Tokyo Ghoul:re” otwiera kolejny rozdział historii, łącząc dochodzenie, brutalne konflikty i pytania o tożsamość. Seria przedstawia nowe twarze, ale mocno opiera się na wydarzeniach z wcześniejszych odsłon „Tokyo Ghoul”.