Nastoletni Hodaka ucieka z rodzinnej wyspy do Tokio, gdzie szybko przekonuje się, jak trudne jest samodzielne życie. Poznaje Hinę, dziewczynę posiadającą niezwykłą zdolność poprawiania pogody poprzez modlitwę. Wspólnie zaczynają pomagać mieszkańcom deszczowego miasta, lecz moc Hiny ma wysoką cenę. Weathering With You łączy romans, fantastykę i opowieść o młodych ludziach podejmujących decyzje wbrew oczekiwaniom świata.